La FQS se constituye como entidad de acreditación, impulsando una cultura organizativa de excelencia y un proceso sistemático de mejora continua en el ámbito de los Centros, Servicios y Establecimientos Sanitarios de Castilla y León.

Actualmente se llevan a cabo estudios y trabajos técnicos para la definición de un modelo de acreditación que permita establecer un sistema de evaluación y certificación de la calidad de las prestaciones sanitarias, así como de los Centros, Servicios y Establecimientos Sanitarios.

Asimismo, en su afán por fomentar y difundir la Cultura de Calidad desarrolla otras actividades en este ámbito, destacando: el impulso y asesoramiento de iniciativas de evaluación y certificación proyectadas desde los centros; la elaboración de indicadores y estándares de calidad; el impulso y desarrollo herramientas de Gestión Clínica (Guías de Práctica Clínica, Vías Clínicas, Protocolos...); y la difusión de Buenas Prácticas y "Benchmarking" entre Centros Sanitarios.